8 октября 1998 года было официально создано одно из ключевых подразделений системы национальной безопасности России — Центр специального назначения ФСБ. Инициатором создания Центра выступил тогдашний Директор ФСБ России Владимир Путин.

Целью нового центра стало объединение разрозненных подразделений специального назначения органов безопасности в единый, скоординированный коллектив, способный эффективно реагировать на современные угрозы. Это объединение позволило существенно повысить оперативную эффективность при проведении специальных операций, направленных на пресечение актов терроризма, а также обеспечивать силовую поддержку оперативно-розыскной деятельности в борьбе с организованной преступностью.
Создание Центра специального назначения стало важным шагом в формировании современной структуры силовых подразделений ФСБ. Объединение опыта и ресурсов различных спецподразделений позволило не только усилить возможности антитеррористической защиты страны, но и повысить слаженность действий при сложных и критических операциях, требующих высокой степени профессионализма и оперативной координации.
Сегодня Центр специального назначения ФСБ России остаётся одной из ключевых структур в обеспечении безопасности государства, продолжая традиции эффективного взаимодействия подразделений спецназначения и внедрения современных методов борьбы с угрозами национальной безопасности.